在进入马湾1868之前,首先会经过一个由咸淡水交界自然形成的红树林,还可看到招潮蟹、弹涂鱼、小白鹭和水笔仔。在未有陆路连接市区之前,马湾小岛得天独厚,在战后至过去半个世纪以来得以休养生息,原生树木自然繁衍,而期间几乎没想到遭受到任何重大破坏。
及至马湾大自然公园开园之初,更引入不少外来树种,并建造以地下水为用的两条人工河流,再加上后山连接着昔日渔村的防风堤岸和一片红机林,及村民开垦的田畦和渔塘,以致他们早年种植的一些果树,均大大丰富了此地之生物多样性。湿地是重要的生态系统,提供了栖息地予各种生物,又为人类挡下种种自然灾害。红树林(小湿地)旁的长堤石级更是最佳欣赏美景及打卡的地方。